電影: Miho Arakawa

擁有「火紅眼」少數民族「窟盧塔族」居住在滿載自然資源的美麗森林中，他們嚴守族裡的規定在森林裡生活，亦不能前往外面的世界。平靜的日子卻因為危險程度達S級的強盜集團「幻影旅團」的到來，而有了天翻地覆的轉變。 「幻影旅團」殲滅所有眼睛會在情緒亢奮時變成紅色，被譽為世界七大美色之一的「窟盧塔族」，在這次災難中倖存的少年酷拉皮卡，誓言復仇，並因此成為一名獵人。 小傑與奇犽為尋找身為偉大獵人的父親而繼續前行，但卻收到一則令人震驚的消息：酷拉皮卡的眼睛竟被奪走！沒有人曉得是不是「幻影旅團」所為，當小傑一行...

在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後、並且與貝利亞吸血魔獸戰鬥結束的3年後。2005年，17歲的八神太一已成為高中生。在御台場突然出現了「感染數碼獸」古加獸，以其為契機，太一一行人，與各自的搭檔數碼獸重逢。同時，在他們就讀的月島綜合高中里，新的「被選召的孩子們」，望月芽心轉學而來。太一一行人在御台場搜尋感染數碼獸的途中，與尋找緬因貓獸的芽心相遇。在與扭曲時空中出現的阿爾法獸爭奪緬因貓獸的過程中，太一與大和合力以奧米加獸擊退了阿爾法獸。此後，望月芽心與緬因貓獸成為大家的夥伴。...

緬因貓獸突然發生變異來到了現實世界，被世界樹所操控的數碼獸也陸續登場。在世界崩壞危機之中，孩子們被強制返回到現實世界。在藏身於暑假的校園中，尋求拯救現實世界和數碼世界的方法的時候，他們被捲入了世界樹和恆常性雙方的對立之中。緬因貓被以敵意相向，再次變換形態。為了拯救由於暴走而飽受折磨的緬因貓獸，芽心最終得出了一個答案：「請殺掉小緬」。正當太一感受到芽心的痛苦，並決定執行她的決定的時候，他被捲入到了傑斯獸的攻擊中，被崩壞的大地所吞噬。悲傷和絕望將小光推向黑暗之中，迪路獸黑暗進化為神聖天女獸墮落形態。...

引起異變的緬因貓獸在空間的扭曲中消失之後，泉光子郎拼命地尋找著應對感染數碼獸的對策。然而，高石岳卻發現自己的數碼獸搭檔巴達獸被感染的徵兆。期望安定之人——恆常性藉由八神光的身體，宣告了「重啟」這一解決數碼世界與現實世界危機的手段。然而，這伴隨著一個巨大的犧牲，即數碼獸將失去記憶。隨後，暴走的緬因貓獸出現在御台場。數碼獸們雖然團結一致全力以赴，然而感染卻進一步蔓延。唯一有幸未被感染的甲蟲獸與光子郎告別，進化為力神比多獸。力神比多獸將其他的夥伴以及緬因貓獸推回扭曲中的那一瞬間，數碼世界由於「重啟」被...

在月島綜合高校文化祭當天，會場出現神秘男子，企圖把緬因貓獸帶到空間扭曲的彼方。碰巧相遇的巴魯獸、哥瑪獸、獅子獸進入扭曲救助，卻被謎之男子召喚的帝皇龍甲獸阻止。為了救出緬因貓獸，巴魯獸、哥瑪獸實現了究極進化。然而，緬因貓獸被救出後突發異變，眨眼間就消滅了獅子獸，獨自消失在空間扭曲深處。此時，姬川真希道出真相，感染數碼獸和空間扭曲的源頭就是緬因貓獸。...

全新故事畫面，可以見到孩童時期的冠葉和晶馬兄弟、荻野目桃果的水晶公主（Princess of the Crystal）姿態、以及較早前已經登場的全新角色公主企鵝（プリンチュペンギン）亦相繼出現 . . ....

在因「重啟」而被重新啟動的數碼世界，被選召的孩子們和搭檔數碼獸們重逢。然而，緬因貓獸仍保存有以往的記憶，為尋找芽心卻消失了。在尋找緬因貓獸的過程中，出現了一名身份不明的男子。男子揭露「重啟」是世界樹的意志，孩子們則被機械邪龍獸和鋼鐵海龍獸攻擊。產生共鳴的孩子們與數碼獸搭檔再次究極進化，擊退了機械邪龍獸。然而，芽心被不明男子襲擊，緬因貓獸因此產生恐懼，再次異變。...

後篇將講述TV版後半部分的故事，並解開前篇的謎團。...

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